アニーリング温度（プライマーのTm値）の計算
PCRで使うプライマーの塩基配列（A・T・G・Cだけ）を入れると、Tm値（プライマーが鋳型と結合できなくなる温度の目安）を、Wallace法かGC法で計算します。
くわしい条件を変える（なくても計算できます）
℃
PCRのアニーリング温度は、ふつうTm値より3〜5℃低い温度に設定します
PR
計算方法
Wallace法 短いプライマー（目安14塩基未満）向けの簡単な式です。Tm(℃) ＝ 2×(A の数＋T の数) ＋ 4×(G の数＋C の数)
GC法 長いプライマー向けの式です。Tm(℃) ＝ 64.9 ＋ 41×((G の数＋C の数)−16.4) ÷ 配列の長さ
例：20塩基の配列でGとCが合わせて12個なら、GC法でTm値は64.9＋41×(12−16.4)÷20≒55.9℃です。
Tm値は、2本の鎖の半分が離れる（変性する）温度の目安です。PCRのアニーリング温度は、ふつうTm値より3〜5℃低い温度に設定します。
出典：Wallace法（Tm＝2×(A+T)＋4×(G+C)。Wallaceらの実験式）とGC法（Tm＝64.9＋41×(G+Cの数−16.4)÷配列の長さ。Marmur・Dotyの式にもとづく近似式）の定義
PR
PR
よくある質問
Tm値とは？
DNAの2本の鎖の半分が離れて1本鎖になる温度のことです。プライマー設計の目安に使われます。
Wallace法とGC法はどちらを使う？
短いプライマー（目安14塩基未満）はWallace法、それより長いプライマーはGC法が向いています。
アニーリング温度とTm値の違いは？
Tm値は理論上の目安の温度で、実際のPCRで使うアニーリング温度は、そこから3〜5℃ほど低く設定するのが一般的です。
GとCが多いプライマーはTm値が高い？
はい。GとCの結合はAとTより強いため、GC含量が高いほどTm値は高くなります。
配列にA・T・G・C以外の文字が入っているときは？
計算できません。修飾塩基などを除いた、A・T・G・Cだけの配列を入力してください。
PR
よく一緒に使われる計算
PR
同じ分野のほかの計算
PR
