医療費控除とセルフメディケーション税制の計算
1年に払った医療費と、対象の市販薬の代金を入れると、医療費控除とセルフメディケーション税制のそれぞれの控除額と、所得税・住民税が減る額の目安を比べます。
医療費控除を受けるまでの手順
- 1月1日〜12月31日 その年に払った医療費の領収書を集める
- 申告の前 領収書から「医療費控除の明細書」を作る
- 提出 明細書を確定申告書に添付して所轄の税務署に出す
- そのあと 領収書は申告期限から5年を経過する日まで自分で保存する
還付を受けるための申告は、その年の翌年1月1日から5年間できます。セルフメディケーション税制とは、どちらか一方だけを選びます
計算方法
医療費控除
控除額 ＝（払った医療費 − 保険金などで戻った額）− 10万円（上限200万円）
総所得金額等が200万円未満の人は、10万円のかわりに「総所得金額等の5%」を引きます。このツールでは、10万円と所得の5%の少ない方を引いています。
セルフメディケーション税制
控除額 ＝ 対象の市販薬の代金 − 12,000円（上限88,000円）
その年に健康診断・予防接種・がん検診などを受けていることが条件です。医療費控除とどちらか一方しか使えません。2026年度の税制改正で、スイッチOTC医薬品（病院の薬から市販薬になったもの）の分は期限がなくなり、それ以外の薬の分は期限が5年延びました。2027年分からは、対象の薬に消化器官用薬やOTC検査薬などが加わります。12,000円を超えた分・上限88,000円は変わりません。
減る税金の目安
所得税が減る額 ＝（控除前の所得税 − 控除後の所得税）× 102.1%
所得税は速算表で、課税される所得金額の1,000円未満を切り捨てて計算しています。102.1%は復興特別所得税を含めるためです。
住民税が減る額 ＝ 控除額 × 10%
住民税にも同じ額の医療費控除があり、所得割（所得に応じてかかる住民税の部分のこと）の税率は10%です。課税される所得が控除額より少ない場合は、減るのはその所得までです。住民税の課税所得は所得税と少し違うため、目安です。
出典：国税庁 No.1120 医療費を支払ったとき（医療費控除）、国税庁 No.1129 セルフメディケーション税制、国税庁 No.2260 所得税の税率、厚生労働省 セルフメディケーション税制について、厚生労働省 令和8年度セルフメディケーション推進のための医療費控除の特例措置の拡充
よくある質問
医療費控除でいくら戻ってくる？
戻るのは医療費そのものではなく、控除額に自分の所得税率をかけた分です。たとえば控除額が20万円で所得税率が10%の人なら、所得税から2万円が返ってきます。さらに翌年の住民税（税率10%）も2万円分軽くなるので、合わせておよそ4万円の負担減になります。所得税率は課税される所得で決まり、5%から45%まであります。所得が高い人ほど戻る額は大きくなります。
いつまでに申告すればいい？
払いすぎた税金を返してもらう申告（還付申告）は、その年の翌年1月1日から5年間できます。たとえば2025年に払った医療費なら、2030年12月31日まで申告できます。会社員で確定申告をしていない人は、期限の3月15日にこだわる必要はありません。ただし、すでに確定申告をした年の分をやり直す場合は、期限内なら訂正申告、期限後なら更正の請求となり、更正の請求は申告期限から5年以内です。
領収書は提出する？
提出も郵送も要りません。かわりに「医療費控除の明細書」を作って出します。領収書は自宅で5年間保管し、税務署から求められたら見せられるようにしておきます。健康保険組合から届く「医療費のお知らせ（医療費通知）」を添付すると、そこに載っている分は明細書への記入を省けます。ただし通知は年末近くの受診分が載っていないことが多いので、その分は自分で書き足してください。
医療費が10万円以下でも医療費控除を受けられる？
総所得金額等が200万円未満なら、所得の5%を超えた分が控除されるので、10万円以下でも受けられることがあります。
家族の医療費も合わせられる？
生計を一にする配偶者や家族のために払った医療費は、合わせて申告できます。
市販薬は医療費控除にも入れられる？
病気の治療のために買った薬の代金は、医療費控除の医療費に入れられます。その場合、同じ年にセルフメディケーション税制は使えません。